Tujuan Pendidikan di Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan adalah:
- Menguasai dasar-dasar ilmiah, pengetahuan, metodologi dan ketrampilan dibidang sumberdaya hayati perairan yang berkelanjutan.
- Mampu dan terampil mengelola sumberdaya hayati perairan yang berkelanjutan sesuai perkembangan IPTEK.
- Memiliki jiwa kewirausahaan dibidang sumberdaya perairan